MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Marinobacter aquaeolei VT8 plasmid pMAQU01

Total Repeats: 3595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008738	ATC	2	6	102	107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120536824
2	NC_008738	CTC	2	6	222	227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120536824
3	NC_008738	CAG	2	6	237	242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120536824
4	NC_008738	TCG	2	6	322	327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120536824
5	NC_008738	CAG	2	6	450	455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120536824
6	NC_008738	TCAG	2	8	484	491	25 %	25 %	25 %	25 %	120536824
7	NC_008738	AGT	2	6	499	504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120536824
8	NC_008738	GGT	2	6	506	511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120536824
9	NC_008738	AG	3	6	525	530	50 %	0 %	50 %	0 %	120536824
10	NC_008738	GGT	2	6	552	557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120536824
11	NC_008738	ATA	2	6	610	615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120536824
12	NC_008738	G	6	6	719	724	0 %	0 %	100 %	0 %	120536824
13	NC_008738	AG	3	6	789	794	50 %	0 %	50 %	0 %	120536824
14	NC_008738	GAT	2	6	804	809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120536824
15	NC_008738	TGT	2	6	818	823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120536824
16	NC_008738	TCA	2	6	824	829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120536824
17	NC_008738	ATTG	2	8	882	889	25 %	50 %	25 %	0 %	120536824
18	NC_008738	GTT	2	6	1068	1073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120536824
19	NC_008738	GGC	2	6	1232	1237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120536824
20	NC_008738	GTC	2	6	1269	1274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120536824
21	NC_008738	CCA	2	6	1295	1300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120536824
22	NC_008738	GAA	2	6	1341	1346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120536824
23	NC_008738	T	6	6	1365	1370	0 %	100 %	0 %	0 %	120536824
24	NC_008738	GGT	2	6	1374	1379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120536824
25	NC_008738	ACC	2	6	1401	1406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120536824
26	NC_008738	TGT	2	6	1430	1435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120536824
27	NC_008738	TCG	2	6	1594	1599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120536824
28	NC_008738	GCA	2	6	1628	1633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120536824
29	NC_008738	GGC	2	6	1649	1654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120536824
30	NC_008738	GCC	2	6	1701	1706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120536824
31	NC_008738	CAA	2	6	1716	1721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120536824
32	NC_008738	GCCG	2	8	1782	1789	0 %	0 %	50 %	50 %	120536824
33	NC_008738	CCG	2	6	1934	1939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120536824
34	NC_008738	ATC	2	6	2049	2054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120536824
35	NC_008738	AACA	2	8	2055	2062	75 %	0 %	0 %	25 %	120536824
36	NC_008738	GCC	2	6	2098	2103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120536824
37	NC_008738	GTG	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120536824
38	NC_008738	CCT	2	6	2204	2209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120536824
39	NC_008738	GTAG	2	8	2222	2229	25 %	25 %	50 %	0 %	120536824
40	NC_008738	TGC	2	6	2308	2313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120536824
41	NC_008738	T	7	7	2317	2323	0 %	100 %	0 %	0 %	120536824
42	NC_008738	TTCT	2	8	2397	2404	0 %	75 %	0 %	25 %	120536824
43	NC_008738	GC	4	8	2427	2434	0 %	0 %	50 %	50 %	120536824
44	NC_008738	CGC	3	9	2432	2440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120536824
45	NC_008738	GTC	2	6	2494	2499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120536824
46	NC_008738	GCG	2	6	2515	2520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120536824
47	NC_008738	TCT	2	6	2525	2530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120536824
48	NC_008738	GCT	2	6	2540	2545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120536824
49	NC_008738	ACC	2	6	2557	2562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120536824
50	NC_008738	TGAC	2	8	2563	2570	25 %	25 %	25 %	25 %	120536824
51	NC_008738	TCT	2	6	2573	2578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120536824
52	NC_008738	TGG	2	6	2611	2616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120536824
53	NC_008738	AG	3	6	2642	2647	50 %	0 %	50 %	0 %	120536824
54	NC_008738	CAA	2	6	2690	2695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120536824
55	NC_008738	A	6	6	2744	2749	100 %	0 %	0 %	0 %	120536824
56	NC_008738	CAA	2	6	2901	2906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120536824
57	NC_008738	TCAGC	2	10	2948	2957	20 %	20 %	20 %	40 %	120536824
58	NC_008738	GC	3	6	2956	2961	0 %	0 %	50 %	50 %	120536824
59	NC_008738	AGG	2	6	3008	3013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	120536824
60	NC_008738	CGCC	2	8	3591	3598	0 %	0 %	25 %	75 %	120536825
61	NC_008738	AGC	2	6	3607	3612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120536825
62	NC_008738	ACG	2	6	3614	3619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120536825
63	NC_008738	AAG	2	6	3620	3625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120536825
64	NC_008738	CAT	2	6	3627	3632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120536825
65	NC_008738	ATCG	2	8	3637	3644	25 %	25 %	25 %	25 %	120536825
66	NC_008738	G	6	6	3735	3740	0 %	0 %	100 %	0 %	120536825
67	NC_008738	AC	3	6	3851	3856	50 %	0 %	0 %	50 %	120536825
68	NC_008738	TGA	2	6	3884	3889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120536825
69	NC_008738	GAA	3	9	3982	3990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120536825
70	NC_008738	GCG	2	6	3991	3996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120536825
71	NC_008738	ATG	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120536826
72	NC_008738	CCAA	2	8	4104	4111	50 %	0 %	0 %	50 %	120536826
73	NC_008738	CCA	2	6	4134	4139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120536826
74	NC_008738	GAC	2	6	4183	4188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120536826
75	NC_008738	G	6	6	4220	4225	0 %	0 %	100 %	0 %	120536826
76	NC_008738	GAC	2	6	4246	4251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120536826
77	NC_008738	AAC	2	6	4256	4261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120536826
78	NC_008738	A	7	7	4336	4342	100 %	0 %	0 %	0 %	120536826
79	NC_008738	CCA	2	6	4401	4406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120536826
80	NC_008738	TGT	2	6	4449	4454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	120536826
81	NC_008738	CCGG	2	8	4462	4469	0 %	0 %	50 %	50 %	120536826
82	NC_008738	AT	3	6	4619	4624	50 %	50 %	0 %	0 %	120536826
83	NC_008738	CCCATC	2	12	5077	5088	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	120536827
84	NC_008738	TCC	2	6	5138	5143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120536827
85	NC_008738	GCA	2	6	5151	5156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120536827
86	NC_008738	CGC	2	6	5157	5162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120536827
87	NC_008738	T	6	6	5167	5172	0 %	100 %	0 %	0 %	120536827
88	NC_008738	CAC	2	6	5188	5193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120536827
89	NC_008738	ACC	2	6	5240	5245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120536827
90	NC_008738	A	6	6	5248	5253	100 %	0 %	0 %	0 %	120536827
91	NC_008738	GA	3	6	5262	5267	50 %	0 %	50 %	0 %	120536827
92	NC_008738	CAAC	2	8	5292	5299	50 %	0 %	0 %	50 %	120536827
93	NC_008738	CAA	2	6	5350	5355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120536827
94	NC_008738	ACC	2	6	5364	5369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120536827
95	NC_008738	AGC	2	6	5409	5414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120536828
96	NC_008738	TCA	2	6	5421	5426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120536828
97	NC_008738	GAA	2	6	5464	5469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120536828
98	NC_008738	ACA	2	6	5490	5495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	120536828
99	NC_008738	ATC	2	6	5528	5533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120536828
100	NC_008738	CG	3	6	5567	5572	0 %	0 %	50 %	50 %	120536828
101	NC_008738	CCGAGT	2	12	5573	5584	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	120536828
102	NC_008738	CAGA	2	8	5597	5604	50 %	0 %	25 %	25 %	120536828
103	NC_008738	TTC	2	6	5636	5641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120536828
104	NC_008738	CT	3	6	5657	5662	0 %	50 %	0 %	50 %	120536828
105	NC_008738	TCT	2	6	5680	5685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120536828
106	NC_008738	A	7	7	5934	5940	100 %	0 %	0 %	0 %	120536829
107	NC_008738	GCG	2	6	6039	6044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120536829
108	NC_008738	TGC	2	6	6059	6064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120536829
109	NC_008738	CCT	2	6	6073	6078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120536829
110	NC_008738	GCA	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120536829
111	NC_008738	CAC	2	6	6116	6121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120536829
112	NC_008738	CGG	2	6	6130	6135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	120536829
113	NC_008738	TAC	2	6	6218	6223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	120536829
114	NC_008738	GAT	2	6	6253	6258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120536829
115	NC_008738	CGA	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120536829
116	NC_008738	AC	3	6	6307	6312	50 %	0 %	0 %	50 %	120536829
117	NC_008738	CAC	2	6	6316	6321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120536829
118	NC_008738	A	6	6	6644	6649	100 %	0 %	0 %	0 %	120536830
119	NC_008738	GAA	2	6	6773	6778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	120536830
120	NC_008738	TGG	2	6	6798	6803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	120536830
121	NC_008738	CGAC	2	8	6825	6832	25 %	0 %	25 %	50 %	120536830
122	NC_008738	AAAG	2	8	6863	6870	75 %	0 %	25 %	0 %	120536830
123	NC_008738	CGA	2	6	6872	6877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120536830
124	NC_008738	TAA	2	6	6889	6894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120536830
125	NC_008738	A	6	6	6893	6898	100 %	0 %	0 %	0 %	120536830
126	NC_008738	GAC	2	6	6908	6913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120536830
127	NC_008738	TCT	2	6	6974	6979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	120536830
128	NC_008738	TCAA	2	8	7051	7058	50 %	25 %	0 %	25 %	120536830
129	NC_008738	GCA	2	6	7104	7109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	120536830
130	NC_008738	TAA	2	6	7118	7123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120536830
131	NC_008738	GACT	2	8	7169	7176	25 %	25 %	25 %	25 %	120536830
132	NC_008738	TTA	2	6	7196	7201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120536830
133	NC_008738	AACGAA	2	12	7210	7221	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	120536830
134	NC_008738	ATT	2	6	7246	7251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	120536830
135	NC_008738	T	6	6	7269	7274	0 %	100 %	0 %	0 %	120536830
136	NC_008738	TAA	2	6	7291	7296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	120536830
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299	NC_008738	CGAC	2	8	20253	20260	25 %	0 %	25 %	50 %	120536843
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387	NC_008738	ACC	2	6	25900	25905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	120536848
388	NC_008738	A	6	6	25923	25928	100 %	0 %	0 %	0 %	120536848
389	NC_008738	TGA	2	6	26063	26068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	120536848
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392	NC_008738	GCC	2	6	26338	26343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	120536848
393	NC_008738	TCC	2	6	26362	26367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	120536848
394	NC_008738	TGC	2	6	26526	26531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	120536848
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